قصة انمي Code Geass: Hangyaku no Lelouch R2 تدور في عام 2010، قامت الإمبراطورية المقدسة لبريطانيا بتعيين نفسها كدولة عسكرية مسيطرة، بدأت بغزو اليابان ثم قامت بإعادة تسميتها إلى “المنطقة 11” بعد هزيمتها السريعة، ثم بدأت اليابان مقاومة ضد هؤلاء الغزاة في محاولة لاستعادة الاستقلال. مرت سنة على الثورة السوداء، وهي انتفاضة فاشلة ضد الإمبراطورية البريطانية المقدسة بقيادة المقنع “زيرو”، والذي أصبح في عداد المفقودين مما تسبب في الفشل دون قائد، لتجد مجموعة المقاومة في “المنطقة 11” -الفرسان السود- نفسها عاجزة عن محاربة الوحشية التي ارتكبتها بريتانيا في المنطقة، والتي زادت بشكل كبير من أجل القضاء على أي أمل في تمرد مستقبلي. يعيش “ليلوش لامبيروج” بعد أن فقد كل ذكريات حياته المزدوجة السابقة، بسلام جنبا إلى جنب مع أصدقائه كطالب في مدرسة ثانوية في أكاديمية “أشفورد”. شريكته السابقة “سي سي” غير قادرة على قبول هذا التحول في الأحداث، وتأخذ على عاتقها مهمة تذكيره بهذفه الحقيقي، آملة أن يستيقظ العقل المدبر “زيرو” مرة أخرى لإنهاء ما بدأه…
تتمحور قصة هذا الفلم حول أكاديمية موسيقية يملكها موسيقار ياباني يدعى "دوموتو كازوكي" أحد مستشاري هذا الموسيقار يحقد عليه لأنه تحول من عزف البيانو إلى عزف الأورغ! يقوم ذلك الأخير بقتل أربع موسيقيين بسبب أنهم كانوا السبب في موته ابنه, ثم يخطط لتفجير صالة دوموتو الموسيقية أثناء إقامة الاحتفال وذلك باستعمال خطة بحيث أن أصوات الأروغ هي التي تفجر القنابل واستعمل المجرم موهبة موجودة لديه وهي القدرة على تمييز الأصوات بالسماع (أذن موسيقية). تقوم "أكيبا ريكو" وهي المغنية التي تظهر في غلاف الفلم بمساعدة كونان والشرطة في إيقاف تقدم المجرم قدما وذلك عن طريق الصعود للمنصة وإجبار دوموتو كازوكي على تغيير اللحن. في الأخير يتمكن كونان بمساعدة الشرطية ساتو من القبض على المجرم.
